当院では小鳥さんそれぞれの種類、個体差を勘案しつつ、主訴にそって診察をしていきます。消化器はクチバシ、舌、食道、ソノウ、前胃（腺胃）、後胃（筋胃）、腸、総排泄腔、総排泄孔まで含まれます。これら単発の発症なのか複合的な発症なのか、または他の臓器もからむ疾患なのかを気を付けて判断していきます。

消化器の検査には問診、視診、触診、聴診、ソノウ検査、検便検査、レントゲン検査（造影検査）、超音波検査、血液検査などを行います。飼い主様の主訴をもとに小鳥さんの状態を見つつ検査を進めていきます。

小鳥さんの消化器の診断がついたら次は治療にうつります。治療には内服薬を中心として治療を進めていきます。